下列情形中，需要由全国人民代表大会常务委员会裁决的有（　）。

本题考查的是法的效力层级。

选项A错误，行政法规之间对同一事项的新的一般规定与旧的特别规定不一致，不能确定如何适用，由国务院裁决。

选项B正确，法律之间对同一事项的新的一般规定与旧的特别规定不一致，不能确定如何适用，由全国人民代表大会常务委员会裁决。

选项C错误，地方性法规与部门规章之间对同一事项的规定不一致，不能确定如何适用，由国务院提出意见，国务院认为应当适用地方性法规的，应当决定在该地方适用地方性法规的规定；认为应当适用部门规章的，应当提请全国人民代表大会常务委员会裁决。

选项D错误，部门规章之间对同一事项的规定不一致，不能确定如何适用，由国务院裁决。

选项E正确，根据授权制定的法规与法律规定不一致，不能确定如何适用，由全国人民代表大会常务委员会裁决。

故本题的正确选项是BE。