某农村小学使用未经审定的教科书，依据《中华人民共和国义务教育法》的规定，责令其期限改正的机关是（  ）。

本题考查的是《中华人民共和国义务教育法》的相关内容。《中华人民共和国义务教育法》第五十七条规定：“学校有下列情形之一的，由县级人民政府教育行政部门责令限期改正；情节严重的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分：（一）拒绝接收具有接受普通教育能力的残疾适龄儿童、少年随班就读的；（二）分设重点班和非重点班的；（三）违反本法规定开除学生的；（四）选用未经审定的教科书的。”题干中，某小学使用未经审定的教科书应该由县级人民政府教育行政部门责令限期改正。B项正确。

A、C、D三项：均为干扰项。与题干不符，排除。

故正确答案为B。