试题要求：
甲公司欠乙公司贷款50万元，乙公司欠甲公司租金50万元。后甲公司被乙公司兼并，甲公司与乙公司之间的债消灭的原因是（ ）。
试题解析：
答案：A
解析：
A项：甲公司与乙公司合并后，基于规范主体的混同而使债消灭。所以，A项正确。
B项：所以，B项错误。
C项：所以，C项错误。
D项：所以，D项错误。
综上所述，本题的正确选项是A项。
考点：债的发生、变更和消灭
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