试题要求：
分别计算在业务（1）中该制药公司应当扣缴的企业所得税、增值税、城市维护建设税、教育费附加及地方教育附加金额。
试题解析：
答案：
①应当扣缴企业所得税＝120÷（1＋6%）×20%×25%＝5.66（万元）
②应当扣缴增值税＝120÷（1＋6%）×6%＝6.79（万元）
③应当扣缴城市维护建设税＝6.79×7%＝0.48（万元）
④应当扣缴教育费附加＝6.79×3%＝0.20（万元）
⑤应当扣缴地方教育附加＝6.79×2%＝0.14（万元）
解析：
①技术咨询指导费是含税收入要注意换算成不含税收入。
本题中，境外股东企业常年派遣指导专员驻本公司并对其工作成果承担全部责任和风险，此情形视同该境外企业在中国境内设有机构场所，适用25%的税率。
该制药公司应当扣缴企业所得税=120÷（1+6%）×20%×25%=5.66（万元）。
②技术咨询指导费适用增值税税率为6%，应当扣缴增值税=120÷（1+6%）×6%=6.79（万元）。
③该制药公司位于市区，适用城建税税率为7%。应当扣缴城市维护建设税=6.79×7%=0.48（万元）。
④应当扣缴教育费附加=6.79×3%=0.20（万元）。
⑤应当扣缴地方教育附加=6.79×2%=0.14（万元）。
考点：企业所得税应纳税额的计算,应纳税额的计算,企业所得税法