下列关于法治思维的理解，正确的是（）。

A项：法治思维是程序思维而不是实体思维。所以，A项错误。

B项：合法性判断是法治思维的核心内容。所以，B项正确。

C项：法治思维是将法律作为判断是非和处理事务的准绳，主要是行政机关采用的思维方式。所以，C项错误。

D项：法治思维是按照社会主义法治的逻辑来观察、分析和解决社会问题的思维方式，是实践思维。所以，D项错误。

综上所述，本题的正确答案为B。