根据《水闸安全鉴定管理办法》（水建管〔2008〕214号），某水闸工程鉴定结论为：运用指标达不到设计标准，工程存在严重损坏，经除险加固后，才能正常运行。该水闸安全类别应为（ ）类闸。

本题考查水闸安全类别划分。

根据《水闸安全鉴定管理办法》 (水建管〔2008〕214 号) ，水闸安全类别划分为四类：

一类闸：运用指标能达到设计标准，无影响正常运行的缺陷，按常规维修养护即可保证正常运行。

二类闸：运用指标基本达到设计标准，工程存在一定损坏，经大修后，可达到正常运行。

三类闸：运用指标达不到设计标准，工程存在严重损坏，经除险加固后，才能达到正常运行。

四类闸：运用指标无法达到设计标准，工程存在严重安全问题，需降低标准运用或报废重建。

故本题最符合题意的选项为C。